Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
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ECM1Q16610 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ECM1Q16610 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
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ECM1Q16610 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AL133260.2-201ENST00000445833 396 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ECM1Q16610 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
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