Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AP2B1-215ENST00000616681 3267 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 OR9I1-203ENST00000641478 3027 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 TRIM6-TRIM34-201ENST00000354852 3391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HMGCS2-204ENST00000544913 1925 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ATXN2-214ENST00000535949 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ANKRD46-201ENST00000335659 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SLCO1A2-212ENST00000458504 2008 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ZC3H11B-201ENST00000367211 2994 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ELMO2-203ENST00000372176 3678 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RGPD1-201ENST00000398193 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 FAM135A-207ENST00000457062 5282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LINC02008-201ENST00000470263 1951 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ADAMTS9-AS2-203ENST00000481312 1970 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MIR640-201ENST00000385086 96 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNA5SP418-201ENST00000515951 117 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AP001208.1-201ENST00000518612 408 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC027544.3-201ENST00000535082 757 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
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SKIV2LQ15477 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ATP10D-201ENST00000273859 6655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 BBOX1-204ENST00000528583 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 MED6-212ENST00000615788 1700 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 KDM4C-215ENST00000543771 3332 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 SLF1-201ENST00000265140 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 ERBIN-205ENST00000416865 2351 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 PDE11A-212ENST00000358450 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 LINC01697-202ENST00000426534 1764 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC7.02□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.28
SKIV2LQ15477 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 FYB1-210ENST00000515010 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 LRAT-206ENST00000507827 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 TMEM155-203ENST00000394396 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 AL022100.2-201ENST00000422548 389 ntTSL 3 BASIC7.02□□□□□ -1.29
SKIV2LQ15477 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC7.02□□□□□ -1.29
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