Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 GYG1P1-201ENST00000460864 698 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CERS6-AS1-204ENST00000599361 536 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC073544.2-201ENST00000601155 540 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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SEC23BQ15437 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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SEC23BQ15437 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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SEC23BQ15437 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
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