Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC105402.2-201ENST00000438503 358 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC073864.1-201ENST00000540161 562 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 NPM1P6-201ENST00000521088 871 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ALCAMQ13740 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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