Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC073587.1-201ENST00000447093 876 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ASH1L-IT1-201ENST00000458371 448 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MTND2P11-201ENST00000423638 648 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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TCOF1Q13428 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AL035458.1-201ENST00000433096 585 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC011825.1-201ENST00000484967 388 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
TCOF1Q13428 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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