Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RN7SL817P-201ENST00000480777 288 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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SNTA1Q13424 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
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SNTA1Q13424 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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SNTA1Q13424 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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SNTA1Q13424 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 DARS-AS1-211ENST00000595061 720 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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SNTA1Q13424 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
SNTA1Q13424 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
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