Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SNX10-204ENST00000409838 944 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL672167.1-201ENST00000441381 464 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
TRAF1Q13077 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms