Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 GLRX-206ENST00000508780 533 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC133634.1-201ENST00000517695 566 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC025265.1-201ENST00000551299 497 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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GRIK2Q13002 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GRIK2Q13002 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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