Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL161722.2-201ENST00000434731 981 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 NR3C2-202ENST00000344721 5712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
FOXF2Q12947 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
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