Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 AL442639.1-201ENST00000625030 1899 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
LMAN2Q12907 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC007738.1-201ENST00000413892 348 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
LMAN2Q12907 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
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