Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PGGT1BP53609 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
PGGT1BP53609 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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