Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL133247.2-201ENST00000603236 482 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
PTPRMP28827 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC087241.4-201ENST00000612441 480 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 YES1-203ENST00000577961 4554 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC007271.1-201ENST00000428188 382 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 RAB28P3-201ENST00000448325 597 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
PTPRMP28827 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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