Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PTP4A2-219ENST00000626355 606 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ACACA-240ENST00000617649 7912 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PDGFRA-201ENST00000257290 6576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ZNF658B-201ENST00000602828 3408 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MTND4LP17-201ENST00000414607 293 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC073172.2-201ENST00000527770 571 ntTSL 4 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 HEMK1-203ENST00000434410 17064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ANKRD44-201ENST00000282272 5147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
HOXD8P13378 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
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