Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 RN7SL697P-201ENST00000582484 299 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 OR1X1P-201ENST00000606159 931 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 AC245028.3-201ENST00000618197 285 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MSH5O43196 STXBP5-204ENST00000367481 9177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MSH5O43196 RCBTB1-201ENST00000258646 3816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ZNF235-201ENST00000291182 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MSH5O43196 JAKMIP2-201ENST00000265272 6001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ZNF226-213ENST00000588883 5972 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MSH5O43196 MAGEC1-201ENST00000285879 4270 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ADGRF1-201ENST00000283297 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 GMFB-209ENST00000616146 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 C10orf67-204ENST00000636213 3981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 PAFAH2-201ENST00000374282 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 R3HCC1L-203ENST00000370584 3372 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 TM2D2-203ENST00000456845 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 PPWD1-201ENST00000261308 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 PPWD1-214ENST00000535264 2195 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 EIF3L-203ENST00000412331 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 CPM-202ENST00000546373 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ZMYND8-201ENST00000262975 4139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 AMOT-204ENST00000371962 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 KLF8-206ENST00000640927 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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MSH5O43196 LPIN1-202ENST00000396097 5690 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 CTH-202ENST00000370938 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 CXCR6-204ENST00000458629 2805 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 CORO1C-202ENST00000420959 3921 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 TRIM49-201ENST00000329758 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 DET1-202ENST00000444300 2154 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 TRIM49C-201ENST00000448984 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 TRIM49B-202ENST00000622138 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
MSH5O43196 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MSH5O43196 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
MSH5O43196 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MSH5O43196 BTBD7-208ENST00000555525 2328 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MSH5O43196 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MSH5O43196 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
MSH5O43196 IL1R1-208ENST00000424272 2658 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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