Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 LINC01935-201ENST00000431897 437 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC096543.1-201ENST00000455038 823 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 HMMR-AS1-202ENST00000521666 800 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC012103.1-201ENST00000522281 780 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 Z97832.1-201ENST00000402490 328 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
SHOC2Q9UQ13 PSMD10P3-201ENST00000437000 448 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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