Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL450263.2-201ENST00000439400 589 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ARL4AP1-201ENST00000503220 705 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC02156-201ENST00000552320 483 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC01633-201ENST00000566476 1091 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 DNAJC9-AS1-204ENST00000440197 2865 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 FOXP2-226ENST00000635638 2598 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
USP35Q9P2H5 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
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