Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SNCA-213ENST00000618500 3022 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CREM-201ENST00000337656 900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC009704.2-201ENST00000618739 483 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms