Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC005304.1-201ENST00000457609 405 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC013652.1-202ENST00000561058 570 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC010425.1-201ENST00000511734 554 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
IMPG1Q17R60 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
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