Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SGCD-202ENST00000435422 9755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC004448.2-201ENST00000422360 586 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RNU1-15P-201ENST00000353977 144 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LSM5-206ENST00000409987 504 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ODF2L-203ENST00000359242 7560 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL391832.1-201ENST00000423963 423 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 TNKS2-AS1-201ENST00000432246 609 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 CHRM3-AS2-209ENST00000628573 766 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 PCDH15-230ENST00000617051 7048 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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