Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 DNAJC10-208ENST00000537515 1669 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 AC083800.1-201ENST00000490594 246 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
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SGCAQ16586 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MTND5P21-201ENST00000531961 522 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC005242.1-201ENST00000585658 438 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SGCAQ16586 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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