Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 YRDCP3-201ENST00000456507 480 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC107373.1-201ENST00000522570 603 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL110118.1-201ENST00000553543 400 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PRR21-201ENST00000408934 1170 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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VAMP3Q15836 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 PTK2-220ENST00000520151 573 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC010424.2-201ENST00000607594 443 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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