Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC011453.2-201ENST00000603737 729 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC099654.1-201ENST00000442649 407 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AP003733.3-201ENST00000524942 788 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC009101.1-201ENST00000568135 242 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC008543.4-201ENST00000585694 442 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC022079.2-201ENST00000619739 566 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
EXOSC2Q13868 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.5 ms