Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 MUC4-209ENST00000463781 17110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 KIAA0391-201ENST00000250377 6118 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 FCGR1B-209ENST00000616817 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 OR51E1-201ENST00000396952 3612 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RNA5SP485-201ENST00000365053 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC104463.1-201ENST00000411431 365 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 CYLD-207ENST00000564326 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 PTK2-207ENST00000517887 4661 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 SYNPO2-206ENST00000610556 3934 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCCD1P59942 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.3 ms