Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC022929.1-201ENST00000560675 823 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AL392112.1-201ENST00000605115 829 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RNU6-891P-201ENST00000384280 111 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC092691.2-201ENST00000461787 803 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AP001001.1-202ENST00000527594 692 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AP001970.1-201ENST00000531681 701 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 ADAMTS9-AS1-210ENST00000625328 699 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
HLA-DMAP28067 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms