Protein–RNA interactions for Protein: O60809

PRAMEF10, PRAME family member 10, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF10O60809 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 LINC02144-201ENST00000511417 592 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRAMEF10O60809 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.9 ms