Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 COX6CP4-201ENST00000605798 228 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CHORDC1-206ENST00000529987 1698 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 TTC21B-201ENST00000243344 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
HOXA3O43365 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AGBL4-201ENST00000334103 881 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 OSBPL10-AS1-202ENST00000418728 458 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
HOXA3O43365 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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