Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 KRR1-202ENST00000438169 975 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC103843.1-201ENST00000527318 682 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AJ009632.2-203ENST00000634708 1205 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DST-205ENST00000370765 8999 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00894-203ENST00000432696 298 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NMNAT1P1-201ENST00000554095 876 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CD84-208ENST00000534968 7885 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
CAPN6Q9Y6Q1 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
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