Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AP001437.1-201ENST00000608783 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC126177.8-201ENST00000618339 1015 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL683826.1-201ENST00000624104 627 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 C12orf4-209ENST00000545746 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC078883.1-203ENST00000416080 654 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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BBS9Q3SYG4 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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BBS9Q3SYG4 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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BBS9Q3SYG4 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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BBS9Q3SYG4 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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BBS9Q3SYG4 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 FAM114A2-210ENST00000520313 1394 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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BBS9Q3SYG4 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
BBS9Q3SYG4 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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