Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.52□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC116096.1-201ENST00000566804 2314 ntBASIC4.52□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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COL24A1Q17RW2 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AL596218.1-201ENST00000634239 1140 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AL691447.1-201ENST00000419456 387 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
COL24A1Q17RW2 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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