Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 SIAH1P1-201ENST00000479411 923 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ANLN-202ENST00000396068 4661 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CDKAL1-202ENST00000378610 3115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 WDCP-201ENST00000295148 3817 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC027308.1-201ENST00000517993 110 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 DMD-222ENST00000474231 5209 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 PHC3-203ENST00000467570 2595 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms