Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC00704-201ENST00000430998 1478 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RNA5SP231-201ENST00000410496 138 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MTUS2-AS2-202ENST00000434779 720 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 CEACAMP11-201ENST00000455211 583 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SOX2-OT-207ENST00000476964 606 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 TM6SF1-207ENST00000565774 1020 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 LINC01477-201ENST00000566101 1226 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC090283.1-201ENST00000582101 265 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL049829.3-202ENST00000604278 711 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AL354976.1-201ENST00000613843 387 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MIR6829-201ENST00000620375 67 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
VAMP3Q15836 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC01980-201ENST00000414382 543 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 AC114878.1-201ENST00000441166 358 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
VAMP3Q15836 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.3 ms