Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC092375.1-202ENST00000639452 404 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
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RAB39AQ14964 CDC123-202ENST00000378900 933 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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RAB39AQ14964 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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RAB39AQ14964 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL355339.1-202ENST00000417542 458 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
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RAB39AQ14964 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL355339.1-201ENST00000434386 435 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC062004.1-202ENST00000524014 246 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
RAB39AQ14964 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
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