Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC003991.1-205ENST00000447758 625 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 HNRNPKP5-201ENST00000515300 253 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OSBPL11-201ENST00000296220 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
ATP1A4Q13733 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
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