Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL136084.2-203ENST00000630758 690 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
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CDH18Q13634 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
CDH18Q13634 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC091046.3-201ENST00000631455 1574 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL391645.1-201ENST00000417409 506 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 HGF-202ENST00000354224 1425 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 TRBV26OR9-2-201ENST00000432077 293 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
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CDH18Q13634 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CDH18Q13634 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
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