Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 NMD3P2-201ENST00000421815 761 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RBMY2TP-201ENST00000451162 947 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL022238.2-202ENST00000607915 658 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GAS2L3-202ENST00000537247 2742 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 OR9K1P-202ENST00000641111 3217 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 UGT2B26P-201ENST00000508672 1613 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXE3Q13461 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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