Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OR4K15-202ENST00000641512 1216 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 TSPAN8-202ENST00000393330 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 HYKK-202ENST00000408962 847 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
PTP4A2Q12974 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms