Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 EIF4ENIF1-201ENST00000330125 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 NCKAP5-204ENST00000409213 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.96
CACNB1Q02641 TRPM3-210ENST00000377111 4618 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 TACC1-207ENST00000519416 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 TACC1-210ENST00000520615 5509 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 LINC01555-201ENST00000370624 2884 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RNA5SP265-201ENST00000411023 111 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC126124.1-201ENST00000426104 185 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RPL12P4-201ENST00000432629 497 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 DBIL5P-202ENST00000453414 250 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RPL12P32-201ENST00000484010 494 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC079795.1-201ENST00000508847 358 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC025437.1-201ENST00000523820 346 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC079313.2-202ENST00000552053 511 ntTSL 3 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SRMP2-201ENST00000553832 916 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SRSF5-206ENST00000554021 567 ntTSL 4 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SNRPD1-201ENST00000300413 4909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RC3H1-203ENST00000367696 11261 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SLC6A2-206ENST00000567238 3160 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AL133279.3-201ENST00000563140 2352 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SLCO1C1-207ENST00000540354 2529 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 YAF2-201ENST00000327791 4156 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC099753.1-201ENST00000634947 2118 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 PTP4A2-218ENST00000602725 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 LINC00934-202ENST00000630357 2291 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AL591848.3-201ENST00000570141 2968 ntBASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SOX5-202ENST00000381381 3991 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 PKD1L1-201ENST00000289672 9092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 MAP3K13-209ENST00000443863 3025 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 NPL-201ENST00000258317 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 POT1-201ENST00000357628 4080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 ETS1-204ENST00000526145 3389 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 CHD7-201ENST00000423902 11568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AL121835.2-201ENST00000624253 3502 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SPRY1-202ENST00000394339 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 EIF4E3-204ENST00000425534 9949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 ZNF10-201ENST00000248211 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 KIAA1217-202ENST00000376451 7383 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 CABYR-202ENST00000399481 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RPL12P13-201ENST00000310055 497 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 IGKC-201ENST00000390237 523 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RBMY2FP-202ENST00000420346 1263 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC008496.2-201ENST00000421252 460 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 LINC00390-201ENST00000432331 340 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 MBNL1-213ENST00000465907 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 B4GALNT2P1-201ENST00000508857 307 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 COPZ1-215ENST00000552362 575 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC233290.2-201ENST00000552852 390 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 CCDC32-212ENST00000560305 557 ntTSL 4 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 APOC2-202ENST00000585786 880 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC018737.1-201ENST00000603900 204 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC113554.1-201ENST00000606284 490 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 RHOXF1P2-201ENST00000635431 502 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SMG7-216ENST00000638826 219 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 NQO1-203ENST00000379047 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 CRYBG3-201ENST00000389622 10729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AL031123.2-201ENST00000563225 3325 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 YOD1-202ENST00000367084 6291 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 SVEP1-202ENST00000374469 12194 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 MET-204ENST00000436117 2295 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 MAGT1-205ENST00000618282 2788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
CACNB1Q02641 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.2 ms