Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CENPFP49454 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CENPFP49454 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
CENPFP49454 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
CENPFP49454 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
CENPFP49454 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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CENPFP49454 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
CENPFP49454 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CENPFP49454 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
CENPFP49454 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
CENPFP49454 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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