Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PCA3_2.1-201ENST00000612507 409 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 VN1R40P-201ENST00000455196 941 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 RANBP3L-201ENST00000296604 3104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
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PTPRMP28827 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
PTPRMP28827 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
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