Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 GALNT13-202ENST00000409237 2591 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 YWHAEP5-201ENST00000431545 765 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP37-201ENST00000479658 549 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 FGB-207ENST00000509493 1164 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFD2P4-201ENST00000515074 1025 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC136619.2-201ENST00000563361 631 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD6IPP2-207ENST00000566321 1069 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC012435.1-202ENST00000568772 240 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL121873.1-201ENST00000616013 524 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MTM1-203ENST00000370396 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC009313.2-201ENST00000417893 1941 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO1P52-201ENST00000433928 531 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
SH3BP1Q9Y3L3 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms