Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 WDR89-201ENST00000267522 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
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USP18Q9UMW8 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 DNAH12-203ENST00000389536 2613 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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USP18Q9UMW8 TNFAIP8-207ENST00000513374 1385 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
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USP18Q9UMW8 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
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USP18Q9UMW8 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 YPEL5-204ENST00000402003 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 EFCAB3-201ENST00000305286 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
USP18Q9UMW8 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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