Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 EI24P4-201ENST00000423683 1078 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AP003774.4-201ENST00000447028 672 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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EHD3Q9NZN3 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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EHD3Q9NZN3 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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EHD3Q9NZN3 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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EHD3Q9NZN3 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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EHD3Q9NZN3 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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EHD3Q9NZN3 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
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EHD3Q9NZN3 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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EHD3Q9NZN3 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
EHD3Q9NZN3 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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