Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 IMMTP1-201ENST00000435590 2219 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC010928.1-201ENST00000592477 1447 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC6.41□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RPL17P2-201ENST00000491913 451 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AC115286.1-201ENST00000604298 434 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 OGT-201ENST00000373701 3310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
GRIK4Q16099 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 UBR4-204ENST00000375254 15906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-74P-201ENST00000384235 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
GRIK4Q16099 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms