Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AP000472.1-201ENST00000452500 530 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC095057.1-201ENST00000507583 168 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC091979.1-201ENST00000517595 706 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC011603.3-201ENST00000549516 279 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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COL19A1Q14993 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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COL19A1Q14993 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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COL19A1Q14993 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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COL19A1Q14993 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
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COL19A1Q14993 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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COL19A1Q14993 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
COL19A1Q14993 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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