Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 STEAP4-202ENST00000380079 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 OR4K17-201ENST00000315543 1032 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 MTND4LP14-201ENST00000429447 288 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPS15AP29-201ENST00000445539 400 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC138956.1-201ENST00000508187 504 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CR381670.1-201ENST00000624291 1693 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL133419.1-201ENST00000423153 640 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPS26P40-201ENST00000435209 294 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
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CUL1Q13616 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC108721.1-201ENST00000547088 348 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CAPS2-206ENST00000409799 1859 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CUL1Q13616 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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