Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
BPTFQ12830 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC104170.2-201ENST00000424246 678 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 IGHV3-32-201ENST00000519182 355 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 MGP-203ENST00000539261 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 LINC00376-201ENST00000439454 693 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
BPTFQ12830 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms