Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 HMGN1P9-201ENST00000515212 298 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SLC4A7-206ENST00000428386 7385 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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USP35Q9P2H5 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
USP35Q9P2H5 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
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