Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 VCAM1-204ENST00000370119 2483 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 ST18-201ENST00000276480 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 MAGEB18-201ENST00000325250 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 EMSY-201ENST00000334736 5508 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 BICC1-202ENST00000373886 5475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.462-201ENST00000384268 102 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AL590143.1-201ENST00000405071 138 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-6P-201ENST00000410804 122 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 UQCRHP1-204ENST00000424609 274 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 DUTP4-201ENST00000424782 475 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AL356309.1-201ENST00000425153 339 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC099796.1-201ENST00000433377 683 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 SKP1P1-201ENST00000438081 489 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC005808.1-201ENST00000444112 381 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL390P-201ENST00000470634 284 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 AL049541.2-201ENST00000626377 555 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
SPOCK3Q9BQ16 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP24-202ENST00000395183 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 DUXAP8-203ENST00000437781 2398 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC104698.1-201ENST00000435671 276 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 SNORA81.1-201ENST00000458922 177 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
SPOCK3Q9BQ16 FOXP1-AS1-201ENST00000465742 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms