Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 G3BP2-203ENST00000395719 4217 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 VCAN-202ENST00000342785 7154 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 DAZ3-201ENST00000315357 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 DAZ2-201ENST00000382294 3277 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 DAZ4-204ENST00000415508 3277 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 SALL1P1-201ENST00000438101 3837 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 RPGRIP1L-205ENST00000563746 4193 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC005614.1-201ENST00000598952 3653 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 SOX6-211ENST00000528429 2656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 SLC26A5-205ENST00000393723 2174 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 PTPN2-212ENST00000591497 3390 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 FSTL5-202ENST00000379164 4757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 LRP2BP-203ENST00000510776 3055 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 MYRFL-203ENST00000547771 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 GAPVD1-207ENST00000394105 5207 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 ZNF430-201ENST00000261560 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 GAPVD1-203ENST00000312123 4320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC025263.1-201ENST00000501387 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 ZNF502-201ENST00000296091 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 SNORA2C-201ENST00000408564 137 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 VAV3-203ENST00000415432 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AL773545.1-201ENST00000425632 347 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 Z68323.1-201ENST00000450365 519 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC009153.1-201ENST00000485799 496 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 GRPEL2-AS1-201ENST00000521295 401 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 MIR4800-201ENST00000537353 80 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 RN7SL835P-201ENST00000579920 262 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC061709.1-202ENST00000615029 527 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 LINC01742-201ENST00000616333 628 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 PXT1-202ENST00000619547 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AL451054.1-201ENST00000621770 772 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 GLUD1P2-202ENST00000630097 606 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC092821.3-202ENST00000641304 2767 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 SSX7-201ENST00000298181 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 PKP4-AS1-201ENST00000342892 4067 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 CD96-201ENST00000283285 4324 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 CCDC171-201ENST00000380701 6512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 C16orf62-204ENST00000448695 3353 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 FAM217B-202ENST00000360816 5036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 ZNF880-202ENST00000422689 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SAMD5Q5TGI4 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.7 ms