Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP478-201ENST00000364657 115 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 ATP5A1P8-201ENST00000423669 1291 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL121759.1-202ENST00000425746 387 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC128677.1-201ENST00000436016 442 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 GAPDHP20-201ENST00000444107 1007 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC022498.1-201ENST00000449845 696 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AP002954.1-201ENST00000526274 425 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC136285.2-201ENST00000562873 378 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 OR4H6P-201ENST00000563771 921 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 Z98949.1-202ENST00000600211 1282 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 OSBPL9-206ENST00000453295 2842 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 CYLD-210ENST00000566206 3104 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 MECOM-202ENST00000433243 3508 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 NLRP3P1-201ENST00000622303 1785 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.21
CSPP1Q1MSJ5 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 PRPS1-202ENST00000372419 628 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AL121578.2-201ENST00000448797 447 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 IGKV3D-34-201ENST00000522638 302 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AC022509.3-201ENST00000535914 436 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
CSPP1Q1MSJ5 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms